Одним из важнейших направлений интеграции экономики России в европейское экономическое пространство является развитие отношений Калининградской области с Европейским Союзом (ЕС). С 2000 г. область граничит со страной, входящей в блок НАТО, а с 2004 г. область граничит с ЕС.

В связи с тем, что развитие ситуации и проблемы Калининграда могут иметь влияние, выходящее за пределы Калининградской области, а также на страны-члены ЕС, на протяжении более 10 лет Европейская Комиссия активно реализует программу содействия области. С 1991 года ЕС выделил значительные финансовые средства для Калининграда, предоставив содействие TACIS на сумму около 40 млн. EUR в рамках национальной программы для России. Комиссия открыла в Калининграде офис поддержки Тасис. Поддержка ЕС сосредоточена на ряде ключевых направлений, в т.ч.:

Поддержка развития частного сектора, в частности, получили поддержку следующие приоритетные направления:

• Региональное экономическое развитие: поддержка в размере более 10 млн. EUR на развитие Свободной экономической зоны/Особой экономической зоны (СЭЗ/ОЭЗ); укрепление Агентства регионального развития и подготовка стратегии регионального экономического развития; содействие торговле и инвестициям, а также транспорт;
• Реструктуризация предприятий: поддержка в размере около 3 млн. EUR для создания Центра поддержки предприятий и укрепления местного агентства развития малых и средних предприятий (МСП). Особое внимание было уделено рыбной промышленности;
• Развитие людских ресурсов в частном секторе: создание отделения Делового менеджмента на Факультете экономики Российского государственного университета им. И.Канта на сумму 1,3 млн. EUR;
• Содействие инновационным МСП: выделен 1 млн. EUR на технологические парки или «технопарки» для укрепления их потенциала по предоставлению обучения, маркетинговых услуг и общих консультаций в области бизнеса;
• Представительство Еврокомиссии в России и Министерство промышленности и энергетики РФ с конца 2006 года реализуют на территории области проект, направленный на обеспечение притока инвестиций в повышение энергоэффективности в России. Проект предусматривает разработку до конца 2007 года конкретных финансовых механизмов для реализации энергоэффективных проектов.
  Руководителем консорциума по реализации проекта является датская консалтинговая фирма COWI. Другие участники консорциума — компании «Ценеф» (Россия), SWECO (Швеция), Mott McDonald (Великобритания) и Технический университет г. Афины (Греция).

Приграничное сотрудничество, содействие торговле и транзиту посредством создания пограничного управления и развития портов. Так, в настоящее время между Калининградом, Польшей и Литвой существуют 23 пункта пересечения границы. Чтобы обеспечить эффективный поток товаров через свою внешнюю границу, ЕС выделяет инвестиции в физическую инфраструктуру и в обработку, включая модернизацию информационных систем.

Город Калининград был особо выделен в качестве приоритета ЕС в Индикативной программе Тасис для России на 2002-2003 годы, а также в Программе приграничного сотрудничества, с тем, чтобы анклав мог воспользоваться новыми возможностями в результате расширения ЕС. С 2006 года Калининградская область принимает участие в Программе «Соседство» Интеррег III A/Тасис (Литва, Польша и Калининградская область), поддерживающей развитие приграничного сотрудничества между указанными странами. В августе 2006 года руководство Программы Евросоюза одобрило для реализации в Калининградской области 16 проектов на сумму 2,5 млн. ЕВРО, которые будут финансироваться из Европейского фонда регионального развития (ERDE).

Экология «регион находится в постоянной зоне внимания различных экологических организаций Евросоюза, в том числе и его официальных структур. Так, например Калининградская область с октября 2006 года принимает участие и получила финансирование от ЕС на реализацию экологического проекта под названием «Интегрированная система геологической информации в городском управлении для предотвращения экологических рисков», который является составной частью программы Евросоюза «LIFE» для третьих стран.