Важную роль в экономике области играет автомобильный транспорт.

Грузооборот в 2005 году составил 525 млн. тонно-км, из которых около 30% объём перевозок грузовыми автомобилями крупных и средних автопредприятий на коммерческой основе. Пассажирооборот составил 136,5 млн. пассажирокилометров. Индекс тарифов на грузовые перевозки в декабре 2005 года по отношению к декабрю 2004 года составил в среднем 105,9%.

Калининградскими автоперевозчиками перевозится около 70% всех экспортно-импортных грузов области, что значительно превышает среднероссийский показатель. На II Европейской конференции по транспорту на острове Крит в 1994 г. были определены девять трансъевропейских коридоров. Три из них прошли по территории РФ: № 1 (Хельсинки-Таллин-Рига-Каунас-Варшава с ответвлением Рига-Калининград-Гданьск), № 2 (Берлин-Варшава-Минск-Москва) и № 9 (Хельсинки-Санкт-Петербург-Москва).

В международных грузовых автомобильных перевозках Калининградской области участвуют более 4000 автомобилей. Для перевозки пассажиров существуют регулярные автобусные линии между Калининградом и рядом городов Германии, Литвы, Латвии, Польши и других иностранных государств.

В Калининграде также налажено регулярное движение грузовых железнодорожных поездов в страны Евросоюза через Польшу. С начала 2004 года Министерством путей сообщения (МПС) России, ныне ОАО РЖД, открыто регулярное пассажирское железнодорожное сообщение между Калининградом и Берлином, а также другими странами ЕС и основной территорией России.